曼彻斯特大学设立研究生专业的院系:工程与物理科学学院、人文学院、生命科学院、医学和人类科学院。
1、工程与物理科学学院:化学工程与分析科学系、化学系、计算机科学系、地球,大气与环境科学系、电气与电子工程系、材料系、数学系、机械,航空航天与土木工程系、物理和天文学系
2、人文学院:艺术,语言和文化系、环境,教育与发展系(包括发展政策和管理研究所)、法学系、曼彻斯特商学院、社会科学系
3、生命科学院:解剖系、生物化学系、植物学系、免疫学系、生理学系和动物学系
4、医学和人类科学院:牙科系、医学院、护理,助产及社会工作系、药学系、心理科学系