1961年,由于新西兰大学的解散,梅西农业学院变更为梅西学院,成为了惠灵顿维多利亚大学的一部分。1960年,惠灵顿维多利亚大学在北帕成立了分部用于教授远程教育。1963年,惠灵顿维多利亚大学北帕校区与梅西学院合并成立了玛纳瓦图梅西大学学院,同年9月25日,根据1963年梅西大学法案,梅西大学学院成为独立的大学,并于1966年更名为梅西大学至今。
70年代到80年代,是梅西大学历史上发展最快的阶段,学校的学术,教育,行政机构基本上是在这20年中发展起来的。特别是在1963年,梅西大学基本上完成了从农业学院到综合性大学的过度,不过当时各个学院的管理比较混乱,也比较分散。当时梅西大学具有农业和农艺学院,科技学院,兽医学院,自然科学院,人文和社会科学院这5大学院。